2006年6月29日，中国科学院和厦门市人民政府在厦门宾馆签署了共建“中国科学院城市环境研究所”备忘录。中国科学院副院长李家洋与厦门市市长张昌平分别代表院市双方签署了共建中国科学院城市环境研究所备忘录。双方决定，共同投资3亿元人民币在厦门市建设“中国科学院城市环境研究所”。《备忘录》中指出，城市环境研究所的使命是：坚持知识创新、技术创新与区域创新相结合，坚持科技创新与创新创业人才培育相结合，坚持院地共建与国际合作相结合，坚持和院内有关研究所协同与自主发展相结合，为我国城市和城市群的生态规划与建设、环境质量的改善提高和社会经济的可持续发展不断做出科技创新贡献。 

　　出席《备忘录》签署仪式的有中国科学院副院长李家洋、中共厦门市委书记何立峰、厦门市市长张昌平、中国科学院资源环境科学与技术局局长傅伯杰、中国科学院院地合作局局长赵勤、中国科学院生态环境研究中心主任赵景柱以及中国科学院和厦门市人民政府相关部门的领导同志。